有機食品認證包括種植、養殖和加工的全過程。有機食品認證的一般程序包括：生產者向認證機構提出申請，提交符合有機生產和加工的認證材料；認證機構對材料進行評估，并在現場審批

為促進食品衛生，保障人體健康，防止農藥、化肥等化學物質對環境的污染和損害，經認證合格的注冊有機食品認證機構應當執行規定的程序。按照有機食品認證技術標準和有機農業生產技術操作規程申請的農產品及其加工產品。系統評價和認證的過程稱為有機食品認證。認證是以標準化檢驗為基礎的，包括現場檢驗、追溯體系和質量保證體系的實施。